• Văn phòng
• Thanh tra
• Vụ Ngân sách nhà nước
• Vụ Đầu tư
• Vụ I
• Vụ Tài chính hành chính sự nghiệp
• Vụ Chính sách thuế
• Vụ Tài chính các ngân hàng và tổ chức tài chính
• Vụ Chế độ kế toán và kiểm toán
• Vụ Hợp tác quốc tế
• Vụ Pháp chế
• Vụ Tổ chức cán bộ
• Vụ Thi đua Khen thưởng

Cơ quan chuyên ngành trực thuộc

• Cục Quản lý giá
• Cục Quản lý nợ và Tài chính đối ngoại
• Cục Quản lý giám sát bảo hiểm
• Cục Tin học và Thống kê tài chính
• Cục Quản lý công sản
• Cục Kế hoạch Tài chính
• Cục Tài chính doanh nghiệp

Các cơ quan quản lý nhà nước theo từng lĩnh vực cụ thể

• Tổng cục Thuế
• Tổng cục Hải quan
• Tổng cục Dự trữ Nhà nước
• Kho bạc Nhà nước
• Ủy ban Chứng khoán Nhà nước

Đơn vị sự nghiệp trực thuộc

• Viện chiến lược và Chính sách tài chính
• Học viện Tài chính
• Trường Đại học Tài chính - Kế toán
• Trường Đại học Tài chính Quản trị kinh doanh
• Trường Đại học Tài chính - Marketing
• Trường Cao đẳng Tài chính Hải quan
• Tạp chí Tài chính
• Thời báo Tài chính Việt Nam
• Nhà Xuất bản Tài chính
• Trường Bồi dưỡng cán bộ tài chính